№з/п;Назва самостійного структурного підрозділу
1;Управління організації роботи
2;Відділ охорони державної таємниці, технічного та криптографічного захисту інформації
3;Управління матеріального забезпечення та розвитку інфраструктури
4;Управління по роботі з персоналом
5;Управління фінансування, бухгалтерського обліку та звітності
6;Управління моніторингу доходів та обліково-звітних систем
7;Управління обслуговування платників
8;Управління інформаційних технологій
9;Юридичне управління 
10;Управління податків і зборів з юридичних осіб
11;Управління податків і зборів з фізичних осіб
12;Управління аудиту
13;Управління боротьби з відмиванням доходів, одержаних злочинним шляхом
14;Управління погашення боргу
15;Оперативне управління
16;Слідче управління фінансових розслідувань
17;Відділ з питань запобігання та виявлення корупції
18;Управління  комунікацій
19;Управління контролю за обігом та оподаткуванням підакцизних товарів
20;Галицьке управління 
21;Залізничне управління 
22;Личаківське управління 
23;Червоноградське  управління 
24;Стрийське  управління 
25;Городоцьке  управління 
26;Самбірське  управління 
27;Дрогобицьке  управління 
28;Буське управління